Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

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Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRDM8Q9NQV8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRDM8Q9NQV8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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