Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FSCN3Q9NQT6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FSCN3Q9NQT6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms