Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC8

SIX2, Homeobox protein SIX2, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX2Q9NPC8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SIX2Q9NPC8 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SIX2Q9NPC8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIX2Q9NPC8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms