Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PNPLA8Q9NP80 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PNPLA8Q9NP80 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms