Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TUFT1Q9NNX1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TUFT1Q9NNX1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms