Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BRMS1Q9HCU9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
BRMS1Q9HCU9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms