Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
UPF2Q9HAU5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
UPF2Q9HAU5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms