Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2Z4

NKX2-4, Homeobox protein Nkx-2.4, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-4Q9H2Z4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NKX2-4Q9H2Z4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NKX2-4Q9H2Z4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms