Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LHX5Q9H2C1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LHX5Q9H2C1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
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