Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EHD4Q9H223 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EHD4Q9H223 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EHD4Q9H223 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms