Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC8Q9H0W5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC8Q9H0W5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC8Q9H0W5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms