Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0N0

RAB6C, Ras-related protein Rab-6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ9H0N0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RAB6CQ9H0N0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB6CQ9H0N0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms