Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PDGFDQ9GZP0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PDGFDQ9GZP0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms