Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K1

SLC39A8, Zinc transporter ZIP8, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A8Q9C0K1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC39A8Q9C0K1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC39A8Q9C0K1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms