Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
BHLHE41Q9C0J9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BHLHE41Q9C0J9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms