Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZCCHC2Q9C0B9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ZCCHC2Q9C0B9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ZCCHC2Q9C0B9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms