Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EDEM3Q9BZQ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EDEM3Q9BZQ6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
EDEM3Q9BZQ6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms