Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF7Q9BWX1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF7Q9BWX1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms