Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRAIPQ9BWF2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAIPQ9BWF2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms