Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NDUFAF3Q9BU61 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NDUFAF3Q9BU61 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms