Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSL1

UBAC1, Ubiquitin-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAC1Q9BSL1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBAC1Q9BSL1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBAC1Q9BSL1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms