Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM79Q9BSE2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM79Q9BSE2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM79Q9BSE2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms