Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3BQ9BS92 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NIPSNAP3BQ9BS92 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms