Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC39A3Q9BRY0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC39A3Q9BRY0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC39A3Q9BRY0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms