Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP1

PDCD2L, Programmed cell death protein 2-like, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2LQ9BRP1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD2LQ9BRP1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD2LQ9BRP1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD2LQ9BRP1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD2LQ9BRP1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD2LQ9BRP1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD2LQ9BRP1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD2LQ9BRP1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD2LQ9BRP1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD2LQ9BRP1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD2LQ9BRP1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD2LQ9BRP1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD2LQ9BRP1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD2LQ9BRP1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD2LQ9BRP1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD2LQ9BRP1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD2LQ9BRP1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms