Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
MESP1Q9BRJ9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
MESP1Q9BRJ9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms