Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SYT3Q9BQG1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SYT3Q9BQG1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms