Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPX3

NCAPG, Condensin complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPGQ9BPX3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPGQ9BPX3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NCAPGQ9BPX3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms