Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SH3GL3Q99963 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SH3GL3Q99963 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.3 ms