Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBBP8Q99708 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBBP8Q99708 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms