Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CSF3RQ99062 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CSF3RQ99062 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF3RQ99062 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF3RQ99062 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF3RQ99062 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CSF3RQ99062 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSF3RQ99062 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CSF3RQ99062 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF3RQ99062 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF3RQ99062 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CSF3RQ99062 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3RQ99062 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3RQ99062 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3RQ99062 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3RQ99062 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3RQ99062 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3RQ99062 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3RQ99062 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3RQ99062 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3RQ99062 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CSF3RQ99062 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3RQ99062 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3RQ99062 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CSF3RQ99062 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3RQ99062 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3RQ99062 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3RQ99062 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3RQ99062 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3RQ99062 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3RQ99062 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3RQ99062 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3RQ99062 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3RQ99062 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CSF3RQ99062 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3RQ99062 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3RQ99062 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3RQ99062 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CSF3RQ99062 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3RQ99062 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3RQ99062 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CSF3RQ99062 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3RQ99062 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3RQ99062 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3RQ99062 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3RQ99062 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3RQ99062 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3RQ99062 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3RQ99062 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CSF3RQ99062 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CSF3RQ99062 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF3RQ99062 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CSF3RQ99062 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CSF3RQ99062 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms