Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RMDN3Q96TC7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RMDN3Q96TC7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RMDN3Q96TC7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms