Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UHRF1Q96T88 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UHRF1Q96T88 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms