Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF13CQ96RJ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms