Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PHF12Q96QT6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PHF12Q96QT6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms