Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ARXQ96QS3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARXQ96QS3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARXQ96QS3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms