Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GCNAQ96QF7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCNAQ96QF7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCNAQ96QF7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms