Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV4

PNMA5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA5Q96PV4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PNMA5Q96PV4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PNMA5Q96PV4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms