Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GBP5Q96PP8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GBP5Q96PP8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GBP5Q96PP8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GBP5Q96PP8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP5Q96PP8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP5Q96PP8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GBP5Q96PP8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms