Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLIC6Q96NY7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLIC6Q96NY7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLIC6Q96NY7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms