Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RDH12Q96NR8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RDH12Q96NR8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms