Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD6Q96NK8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD6Q96NK8 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD6Q96NK8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD6Q96NK8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD6Q96NK8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NEUROD6Q96NK8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD6Q96NK8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD6Q96NK8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD6Q96NK8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NEUROD6Q96NK8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NEUROD6Q96NK8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NEUROD6Q96NK8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms