Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PRRC1Q96M27 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PRRC1Q96M27 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms