Protein–RNA interactions for Protein: Q96L12

CALR3, Calreticulin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALR3Q96L12 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CALR3Q96L12 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CALR3Q96L12 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CALR3Q96L12 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALR3Q96L12 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALR3Q96L12 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALR3Q96L12 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CALR3Q96L12 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms