Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
PHACTR3Q96KR7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PHACTR3Q96KR7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
PHACTR3Q96KR7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms