Protein–RNA interactions for Protein: Q96KG9

SCYL1, N-terminal kinase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCYL1Q96KG9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCYL1Q96KG9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SCYL1Q96KG9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms