Protein–RNA interactions for Protein: Q96JP9

CDHR1, Cadherin-related family member 1, humanhuman

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR1Q96JP9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDHR1Q96JP9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDHR1Q96JP9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDHR1Q96JP9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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