Protein–RNA interactions for Protein: Q96HM7

PCED1B, PC-esterase domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCED1BQ96HM7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PCED1BQ96HM7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCED1BQ96HM7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 401.6 ms