Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZC2HC1AQ96GY0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ZC2HC1AQ96GY0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms