Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMARCD1Q96GM5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMARCD1Q96GM5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms